DNA亲子鉴定之反复DNA(反复DNA是造成DNA多态性的主要起因之一)

发布日期:2021-07-11浏览量:112

人类基因组DNA长3×109bp,根本上可分为编码DNA和非编码DNA二类。此中编码DNA在基因组中仅占1%~3%,包罗了约莫2~3万个编码卵白质的基因,基因组其他的绝大大都序列为非编码DNA。非编码DNA可分为二类:一类是单拷贝存在模式,如距离DNA,某些调治基因表达的序列等;另外一类是反复DNA,约占基因组30%摆布,浮现为高度变异的多拷贝模式,有的序列在基因组中反复可达10万次以上。反复DNA是造成DNA多态性的主要起因之一。

真核基因组中反复DNA的一个突出特色是复性速率比单拷贝快,应用DNA复性动力学阐明可以证实。用限定酶消化或超声波将基因组DNA剪切成片断,加温使DNA变性,而后低落温度,察看低浓度单链DNA的复性过程。一种法子是紫外分光光度计测定OD260吸光度值,行使逊色效应测定DNA复性比率。二是行使羟磷灰石色谱手艺,已复性的双链DNA份子能连系在羟磷灰石上,单链DNA可经由过程色谱柱。按照DNA复性动力学(reassociation kinet-ics)道理,在一按时间(t)内,DNA复性为双链的速率取决于单链DNA的肇端浓度(Co),可是更关键的影响因素是DNA链中的拷贝数,反复单元的拷贝数越多,DNA的复性越快。 人类DNA遗传标识表记标帜与反复DNA序列结构严密亲密相干。人类反复DNA大抵能分为二类:一类是串联反复DNA;另外一类是散布反复DNA。初期行使氯化铯密度梯度离心手艺研讨人基因组DNA时,发现除主要身额外,基因组内还存在若干次要身分。1982年Singer等证实这些次要身分都是串联反复DNA,厥后将串联反复DNA序列统称为卫星DNA (satellite DNA)。作者将这些次要身分定名为卫星I,Ⅱ,Ⅲ和Ⅳ,加之厥后发现的a-卫星序列,总称经典卫星DNA (classical satellite DNA)成大卫星DNA(macrosatellite DNA)。每回种经典卫星DNA均有雷同的碱基组成,浮力密度沟通,但碱基序列有较大的差距。比方:卫星Ⅲ的反复单元由一rITCCA -五核苷酸组成,a-卫星的反复单元却长达170bp,但两者的浮力密度却非常相近。 经典卫星DNA约莫占人类基因组5%,除此以外,基因组中另有至少占10%的串联反复DNA,散布在基因组各特定的基因座上。按其反复单元的是非,人为地定名为小卫星 ( nunisatellite)和微卫星(microsatellite) DNA。散布反复DNA (dispersed repeatitive DNA)是以沟通的核心序列,散在散布在基因组中,约莫占基因组10%~15%。按反复单元的是非分为长散布反复DNA (long interspersed ele-Ⅱients,LINEs)和短散布反复DNA(short interspersed elements,SINEs)二类。至多见的短散布反复序列是Alu序列,反复单元长300bp,在基因组反复次数达30万。50万次,此中80%~90%的核心序列是一致的,它们独特的特性是核心序列中都含有一个Alu I限定酶辨认点。典型的长散布反复DNA是Ll序列,又称Kpn序列,反复单元长500bp以上,反复次数1万—4万,片断长度0.5kb~ 7kb。散布在基因组中的Ll序列是非差距主要浮此刻5′真个缩短。 散布反复DNA有一独特的特色,均具备转座因子(transposons)效应,它们能自我复制,经由过程反转录体式格式重修新的拷贝,而落后入基因组的另外一适量位置,雷同于逆转录病毒自我复制的体式格式。以是,有作者称这一类反复DNA为自私DNA(selfish DNA)或寄生DNA (parasitic DNA)。更多详情:http://www.qinzijianding.cn

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